1.新石墨舟在第一次运用前建议运用去离子水+10%（体积比）的氢氟酸进行清洗约3~5小时；再用去离子水进行漂洗8~12小时；直到承认舟体没有酸性成分，可在漂洗后用PH试纸测验用过的水或洗过的舟，以承认清洗成果。然后依照要求进行烘干。
      2.运用后石墨舟的清洗：SHF的石墨舟一般在运用100-150次左右需要对其表面的氮化硅进行清洗。建议运用浓度15-25%的氢氟酸溶液，分三轮次来清洗，每次4-5小时，并在浸泡清洗的过程中进行周期性氮气鼓泡，加半小时左右的清洗；留意：鼓泡不建议直接运用空气作为气源。酸洗后用纯水漂洗10小时左右，并承认舟现已彻底清洗干净，请在清洗完毕后查看舟的表面、石墨卡点和舟片结合处、以及其它部位是否还有氮化硅的剩余。然后依照要求进行烘干。
清洗留意事项：
    A）由于HF酸归于强腐蚀性物质并有必定的挥发性，对操作人员有必定的危险性。因此清洗岗位操作人员必须做好安全防护，并进行专人管理。
    B）建议在清洗时将舟拆开后只对石墨部位进行清洗，这样能将各个接触部位清洗的更彻底。目前国内许多厂家选用整体清洗，虽然便利，但由于HF酸对陶瓷部件有必定的腐蚀性，整体清洗会缩短相应部件的运用寿命。